Offres de stages, M.Sc., Ph.D. et postdocs

Présentation du laboratoire de recherche

Le laboratoire s’intéresse aux traits sanguins et aux maladies hématologiques (maladies du globule rouge et cytopénies auto-immunes en particulier) en utilisant principalement des approches de génomique et de génétique. Le laboratoire vise à faire bénéficier les patients atteints de pathologies hématologiques des meilleurs outils disponibles afin de mieux comprendre ces pathologies et de disposer d’outils pronostics. Il cherche également à améliorer la compréhension des traits sanguins et leur utilisation comme biomarqueur en pratique clinique. Il dispose notamment d’une bio-informaticienne à temps plein pour soutenir les étudiants dans les analyses computationnelles.

Description du projet de recherche

Les traits sanguins (nombre et caractéristiques des cellules sanguines) influencent de nombreux processus physiologiques tels que le transport de l’oxygène pour les globules rouges et la défense contre les infections pour les globules blancs. Les traits sanguins du nouveau-né sont particuliers avec en particulier deux spécificités. D’une part ils sont sous l’influence combinée de facteurs maternels et fœtaux. Et d’autre part, l’hémoglobine fœtale représente la plus grande partie de l’hémoglobine du nouveau-né. Cette hémoglobine ayant une plus grande affinité pour l’oxygène, elle favorise le transport de cette molécule de la mère au fœtus et la croissance de ce dernier. Notre connaissance de ces spécificités est toutefois limitée. En effet, la contribution respective de la mère et du fœtus à la régulation des traits sanguins n’est pas connue et l’impact de la variation de l’hémoglobine fœtale sur la croissance du nouveau-né n’a pas été étudiée. Ces limitations compliquent l’interprétation des traits sanguins à la naissance. Hors, la formule sanguine est un des examens le plus souvent effectué chez les nouveaux-nés afin d’évaluer plusieurs traits sanguins. En pratique clinique, l’interpretation des anomalies retrouvées est parfois difficile car leur conséquence n’est pas claire.

La génétique des traits sanguins, incluant l’hémoglobine fœtale, a été étudiée en profondeur dans des populations adultes. Ces données reprèsentent un outil de choix pour répondre aux défis posés par les traits sanguins à la naissance.

Dans ce projet, nous proposons d’utiliser différentes approches de génétique épidémiologique (computationnelle) pour mieux comprendre les spécificités des traits sanguins du nouveau-né et améliorer leur interprétation en clinique. La candidate ou le candidat sera notamment amené à effectuer des analyses de scores polygéniques, de la randomisation mendélienne et des analyses multivariées. Il ou elle travaillera à partir de deux des plus grandes cohortes ayant mesuré les traits sanguins à la naissance et disposant des données de génotypage à la fois de la mère et du nouveau-né.

Ce projet peut être réalisé dans le cadre d’une maitrise ou approfondi et étendu en cas de souhait d’effectuer un doctorat.

Profil et formation recherchés

Nous recherchons une personne motivée et curieuse ayant un interet pour la génétique épidémiologique et l’hématologie. Celle-ci doit avoir un interêt pour le travail en équipe.

Une certaine expérience dans l’utilisation d’outils bio-informatique est requise (utilisation préalable de R et de codes unix). Une connaissance en biologie humaine et en particulier en génétique humaine est un atout.

Un dipôme préalable en sciences biomédicales, génétique, bio-informatique ou équivalent est requis.

L’étudiant(e) doit avoir une connaissance suffisante du français et de l’anglais.

Les candidatures avec une expertise dans la rédaction d’article et l’analyse statistique des données seront privilégiées.

Conditions

La candidate ou le candidat doit s’inscrire à l’Université de Montréal dans un programme pertinent au sujet de recherche (M.Sc. ou Ph.D.). Le financement sera accordé pour la durée du programme d’études. Tous les stagiaires devront néanmoins postuler pour des bourses d’organismes subventionnaires.

Soumettre votre candidature

Les personnes souhaitant postuler doivent faire parvenir les documents requis à Thomas Pincez par courriel à thomas.pincez@umontreal.ca.

Prière de fournir :

• Curriculum vitæ
• Relevé de notes le plus récent
• Lettre de motivation
• Références (2-3)

(Novembre 2024)

Présentation du laboratoire de recherche

Le laboratoire s’intéresse aux traits sanguins et aux maladies hématologiques (maladies du globule rouge et cytopénies auto-immunes en particulier) en utilisant principalement des approches de génomique et de génétique. Le laboratoire vise à faire bénéficier les patients atteints de pathologies hématologiques des meilleurs outils disponibles afin de mieux comprendre ces pathologies et de disposer d’outils pronostics. Il cherche également à améliorer la compréhension des causes génétiques des maladies hématologiques. Il dispose notamment d’une bio-informaticienne à temps plein pour soutenir les étudiants dans les analyses computationnelles.

Description du projet de recherche

Les maladies du globules rouges peuvent conduire à une destruction de celui-ci, phénomène appelé hémolyse. Cette hémolyse conduit à une anémie de sévérité variable mais pouvant nécessiter des transfusions de globules rouges. Des variants génétiques dans les gènes de la membrane du globlue rouge sont retrouvés des plusieurs maladies hémolytiques. Toutefois, de tels variants peuvent également être retrouvés chez des individus sans hémolyse. Ainsi, l’impact des variants affectant les gènes de la membrane du globule rouge est mal connu et probablement affecté par la présence de variants dans d’autres gènes et/ou par la prédisposition polygénique sous-jacente. Ce projet vise à mieux comprendre l’impact de variants associés à l’hémolyse et d’identifier la contribution génétique à l’hémolyse. Ceci aura également un impact clinique en permettant un meilleur conseil génétique et une meilleure prise en charge des patients atteints de maladies hémolytiques.

Le candidat ou la candidate sera amené à travailler à partir de large bases de données (>500 000 individus) pour y effectuer la recherche des variants dans les gènes de maladies du globule rouge. Il ou elle effectuera également des études d’associations pan-génomique afin d’identifier la contribution polygénique à l’hémolyse. L’impact de ces variants et de ces scores seront analysé sur les données biologiques et cliniques des patients. La randomisation mendélienne permettra d’analyser la causalité des associations retrouvées.

Ce projet peut être réalisé dans le cadre d’une maitrise ou approfondi et étendu en cas de souhait d’effectuer un doctorat.

Profil et formation recherchés

Nous recherchons une personne motivée et curieuse ayant un interet pour la génétique épidémiologique et l’hématologie. Celle-ci doit avoir un interêt pour le travail en équipe.

Une certaine expérience dans l’utilisation d’outils bio-informatique est requise (utilisation préalable de R et de codes unix). Une connaissance en biologie humaine et en particulier en génétique humaine est un atout.

Un dipôme préalable en sciences biomédicales, génétique, bio-informatique ou équivalent est requis.

L’étudiant(e) doit avoir une connaissance suffisante du français et de l’anglais.

Les candidatures avec une expertise dans la rédaction d’article et l’analyse statistique des données seront privilégiées.

Conditions

La candidate ou le candidat doit s’inscrire à l’Université de Montréal dans un programme pertinent au sujet de recherche (M.Sc. ou Ph.D.). Le financement sera accordé pour la durée du programme d’études. Tous les stagiaires devront néanmoins postuler pour des bourses d’organismes subventionnaires.

Soumettre votre candidature

Les personnes souhaitant postuler doivent faire parvenir les documents requis à Thomas Pincez par courriel à thomas.pincez@umontreal.ca.

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• Curriculum vitæ
• Relevé de notes le plus récent
• Lettre de motivation
• Références (2-3)

(Novembre 2024)

 La réplication de l’ADN est un processus fondamental qui permet la duplication du matériel génétique et son transfert subséquent aux cellules filles. Les dommages à l’ADN causés par des agents environnementaux ou des médicaments anticancer peuvent empêcher la réplication de l’ADN et provoquer l’instabilité génomique. Notre laboratoire étudie les mécanismes qui permettent aux cellules de répondre aux dommages à l’ADN survenant pendant la réplication. Nos projets de recherche visent à mieux comprendre l’impact de ces mécanismes dans le contexte du cancer de l’ovaire et du mélanome malin; nous utilisons des approches de biologie moléculaire, biochimie, et génétique, ainsi que des modèles expérimentaux allant de la levure aux cellules mammifères en culture. 

Nous recherchons des candidat(e)s pour des études de MSc, PhD, ou postdoctorales intéressé(e)s par la recherche sur le cancer et les mécanismes fondamentaux influençant la stabilité génomique chez les eucaryotes. Les candidat(e)s doivent répondre aux critères d’admissibilité du programme de biologie moléculaire de l’Université de Montréal : des études antérieures dans le domaine de la biochimie et de la biologie moléculaire sont essentielles. Les candidat(e)s ayant une expérience en laboratoire et de solides compétences académiques seront privilégié(e)s. Les projets se dérouleront au Centre de Recherche de l’Hôpital Maisonneuve-Rosemont, une installation de formation de premier plan affiliée à l’Université de Montréal, dans le laboratoire du Dr Hugo Wurtele (https://crhmr.ciusss-estmtl.gouv.qc.ca/en/researcher/hugo-wurtele ). Les candidat(e)s intéressé(e)s doivent envoyer un CV, une lettre de motivation et leurs relevés de notes universitaires. 

Publications appropriées: 

Lemay J-F, St-Hilaire E, Gezzar-Dandashi S, McQuaid M, Ronato DA, Gao Y, Bélanger F, Sawchyn C, Kimenyi Ishimwe AB, Mallette FA, Masson J-Y, Drobetsky EA, Wurtele H (2022) A genome-wide screen identifies SCAI as a modulator of the UV-induced replicative stress response in human cells. PLoS Biol. 2022 Oct 10;20(10) 

Bélanger F, Roussel C, Sawchyn C, Gezzar-Dandashi S, Mallette FA, Wurtele H*, Drobetsky EA* (2023) Control of UV damage repair during S phase via Dyrk1A-dependent regulation of cyclin D1/p21waf1cip1 stability. Journal of Biological Chemistry 8: 104900, doi: 10.1016/j.jbc.2023.104900 

Bélanger F, Fortier E, Dubé M, Lemay JF, Buisson R, Masson JY, Elsherbiny A, Costantino S, Carmona E, Mes-Masson AM, Wurtele H, Drobetsky E. (2018) Replication Protein A Availability during DNA Replication Stress Is a Major Determinant of Cisplatin Resistance in Ovarian Cancer Cells. Cancer Res. 78:5561-5573 

(Août 2024)

Présentation du laboratoire de recherche

Le laboratoire s’intéresse aux traits sanguins et aux maladies hématologiques (maladies du globule rouge et cytopénies auto-immunes en particulier) en utilisant principalement des approches de génomique et de génétique. Le laboratoire vise à faire bénéficier les patients atteints de pathologies hématologiques des meilleurs outils disponibles afin de mieux comprendre ces pathologies et de disposer d’outils pronostics. Il cherche également à améliorer la compréhension des traits sanguins et leur utilisation comme biomarqueur en pratique clinique. Il dispose notamment d’une bio-informaticienne à temps plein pour soutenir les étudiants dans les analyses computationnelles.

Description du projet de recherche

Les traits sanguins (nombre et caractéristiques des cellules sanguines) influencent de nombreux processus physiologiques tels que le transport de l’oxygène pour les globules rouges et la défense contre les infections pour les globules blancs. Les traits sanguins du nouveau-né sont particuliers avec en particulier deux spécificités. D’une part ils sont sous l’influence combinée de facteurs maternels et fœtaux. Et d’autre part, l’hémoglobine fœtale représente la plus grande partie de l’hémoglobine du nouveau-né. Cette hémoglobine ayant une plus grande affinité pour l’oxygène, elle favorise le transport de cette molécule de la mère au fœtus et la croissance de ce dernier. Notre connaissance de ces spécificités est toutefois limitée. En effet, la contribution respective de la mère et du fœtus à la régulation des traits sanguins n’est pas connue et l’impact de la variation de l’hémoglobine fœtale sur la croissance du nouveau-né n’a pas été étudiée. Ces limitations compliquent l’interprétation des traits sanguins à la naissance. Hors, la formule sanguine est un des examens le plus souvent effectué chez les nouveaux-nés afin d’évaluer plusieurs traits sanguins. En pratique clinique, l’interpretation des anomalies retrouvées est parfois difficile car leur conséquence n’est pas claire.

La génétique des traits sanguins, incluant l’hémoglobine fœtale, a été étudiée en profondeur dans des populations adultes. Ces données reprèsentent un outil de choix pour répondre aux défis posés par les traits sanguins à la naissance.

Dans ce projet, nous proposons d’utiliser différentes approches de génétique épidémiologique (computationnelle) pour mieux comprendre les spécificités des traits sanguins du nouveau-né et améliorer leur interprétation en clinique. La candidate ou le candidat sera notamment amené à effectuer des analyses de scores polygéniques, de la randomisation mendélienne et des analyses multivariées. Il ou elle travaillera à partir de deux des plus grandes cohortes ayant mesuré les traits sanguins à la naissance et disposant des données de génotypage à la fois de la mère et du nouveau-né.

Ce projet peut être réalisé dans le cadre d’une maitrise ou approfondi et étendu en cas de souhait d’effectuer un doctorat.

Profil et formation recherchés

Nous recherchons une personne motivée et curieuse ayant un interet pour la génétique épidémiologique et l’hématologie. Celle-ci doit avoir un interêt pour le travail en équipe.

Une certaine expérience dans l’utilisation d’outils bio-informatique est requise (utilisation préalable de R et de codes unix). Une connaissance en biologie humaine et en particulier en génétique humaine est un atout.

Un dipôme préalable en sciences biomédicales, génétique, bio-informatique ou équivalent est requis.

L’étudiant(e) doit avoir une connaissance suffisante du français et de l’anglais.

Les candidatures avec une expertise dans la rédaction d’article et l’analyse statistique des données seront privilégiées.

Conditions

La candidate ou le candidat doit s’inscrire à l’Université de Montréal dans un programme pertinent au sujet de recherche (M.Sc. ou Ph.D.). Le financement sera accordé pour la durée du programme d’études. Tous les stagiaires devront néanmoins postuler pour des bourses d’organismes subventionnaires.

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Les personnes souhaitant postuler doivent faire parvenir les documents requis à Thomas Pincez par courriel à thomas.pincez@umontreal.ca.

Prière de fournir :

• Curriculum vitæ
• Relevé de notes le plus récent
• Lettre de motivation
• Références (2-3)

(Novembre 2024)

Présentation du laboratoire de recherche

Le laboratoire s’intéresse aux traits sanguins et aux maladies hématologiques (maladies du globule rouge et cytopénies auto-immunes en particulier) en utilisant principalement des approches de génomique et de génétique. Le laboratoire vise à faire bénéficier les patients atteints de pathologies hématologiques des meilleurs outils disponibles afin de mieux comprendre ces pathologies et de disposer d’outils pronostics. Il cherche également à améliorer la compréhension des causes génétiques des maladies hématologiques. Il dispose notamment d’une bio-informaticienne à temps plein pour soutenir les étudiants dans les analyses computationnelles.

Description du projet de recherche

Les maladies du globules rouges peuvent conduire à une destruction de celui-ci, phénomène appelé hémolyse. Cette hémolyse conduit à une anémie de sévérité variable mais pouvant nécessiter des transfusions de globules rouges. Des variants génétiques dans les gènes de la membrane du globlue rouge sont retrouvés des plusieurs maladies hémolytiques. Toutefois, de tels variants peuvent également être retrouvés chez des individus sans hémolyse. Ainsi, l’impact des variants affectant les gènes de la membrane du globule rouge est mal connu et probablement affecté par la présence de variants dans d’autres gènes et/ou par la prédisposition polygénique sous-jacente. Ce projet vise à mieux comprendre l’impact de variants associés à l’hémolyse et d’identifier la contribution génétique à l’hémolyse. Ceci aura également un impact clinique en permettant un meilleur conseil génétique et une meilleure prise en charge des patients atteints de maladies hémolytiques.

Le candidat ou la candidate sera amené à travailler à partir de large bases de données (>500 000 individus) pour y effectuer la recherche des variants dans les gènes de maladies du globule rouge. Il ou elle effectuera également des études d’associations pan-génomique afin d’identifier la contribution polygénique à l’hémolyse. L’impact de ces variants et de ces scores seront analysé sur les données biologiques et cliniques des patients. La randomisation mendélienne permettra d’analyser la causalité des associations retrouvées.

Ce projet peut être réalisé dans le cadre d’une maitrise ou approfondi et étendu en cas de souhait d’effectuer un doctorat.

Profil et formation recherchés

Nous recherchons une personne motivée et curieuse ayant un interet pour la génétique épidémiologique et l’hématologie. Celle-ci doit avoir un interêt pour le travail en équipe.

Une certaine expérience dans l’utilisation d’outils bio-informatique est requise (utilisation préalable de R et de codes unix). Une connaissance en biologie humaine et en particulier en génétique humaine est un atout.

Un dipôme préalable en sciences biomédicales, génétique, bio-informatique ou équivalent est requis.

L’étudiant(e) doit avoir une connaissance suffisante du français et de l’anglais.

Les candidatures avec une expertise dans la rédaction d’article et l’analyse statistique des données seront privilégiées.

Conditions

La candidate ou le candidat doit s’inscrire à l’Université de Montréal dans un programme pertinent au sujet de recherche (M.Sc. ou Ph.D.). Le financement sera accordé pour la durée du programme d’études. Tous les stagiaires devront néanmoins postuler pour des bourses d’organismes subventionnaires.

Soumettre votre candidature

Les personnes souhaitant postuler doivent faire parvenir les documents requis à Thomas Pincez par courriel à thomas.pincez@umontreal.ca.

Prière de fournir :

• Curriculum vitæ
• Relevé de notes le plus récent
• Lettre de motivation
• Références (2-3)

(Novembre 2024)

La réplication de l’ADN est un processus fondamental qui permet la duplication du matériel génétique et son transfert subséquent aux cellules filles. Les dommages à l’ADN causés par des agents environnementaux ou des médicaments anticancer peuvent empêcher la réplication de l’ADN et provoquer l’instabilité génomique. Notre laboratoire étudie les mécanismes qui permettent aux cellules de répondre aux dommages à l’ADN survenant pendant la réplication. Nos projets de recherche visent à mieux comprendre l’impact de ces mécanismes dans le contexte du cancer de l’ovaire et du mélanome malin; nous utilisons des approches de biologie moléculaire, biochimie, et génétique, ainsi que des modèles expérimentaux allant de la levure aux cellules mammifères en culture.

Nous recherchons des candidat(e)s pour des études de MSc, PhD, ou postdoctorales intéressé(e)s par la recherche sur le cancer et les mécanismes fondamentaux influençant la stabilité génomique chez les eucaryotes. Les candidat(e)s doivent répondre aux critères d’admissibilité du programme de biologie moléculaire de l’Université de Montréal : des études antérieures dans le domaine de la biochimie et de la biologie moléculaire sont essentielles. Les candidat(e)s ayant une expérience en laboratoire et de solides compétences académiques seront privilégié(e)s. Les projets se dérouleront au Centre de Recherche de l’Hôpital Maisonneuve-Rosemont, une installation de formation de premier plan affiliée à l’Université de Montréal, dans le laboratoire du Dr Hugo Wurtele (https://crhmr.ciusss-estmtl.gouv.qc.ca/en/researcher/hugo-wurtele ). Les candidat(e)s intéressé(e)s doivent envoyer un CV, une lettre de motivation et leurs relevés de notes universitaires.

Publications appropriées:

Lemay J-F, St-Hilaire E, Gezzar-Dandashi S, McQuaid M, Ronato DA, Gao Y, Bélanger F, Sawchyn C, Kimenyi Ishimwe AB, Mallette FA, Masson J-Y, Drobetsky EA, Wurtele H (2022) A genome-wide screen identifies SCAI as a modulator of the UV-induced replicative stress response in human cells. PLoS Biol. 2022 Oct 10;20(10)

Bélanger F, Roussel C, Sawchyn C, Gezzar-Dandashi S, Mallette FA, Wurtele H*, Drobetsky EA* (2023) Control of UV damage repair during S phase via Dyrk1A-dependent regulation of cyclin D1/p21waf1cip1 stability. Journal of Biological Chemistry 8: 104900, doi: 10.1016/j.jbc.2023.104900

Bélanger F, Fortier E, Dubé M, Lemay JF, Buisson R, Masson JY, Elsherbiny A, Costantino S, Carmona E, Mes-Masson AM, Wurtele H, Drobetsky E. (2018) Replication Protein A Availability during DNA Replication Stress Is a Major Determinant of Cisplatin Resistance in Ovarian Cancer Cells. Cancer Res. 78:5561-5573

(Août 2024)

La gamma-carboxylation est une modification post-traductionnelle qui cible les résidus d’acides glutamiques, se produit dans le réticulum endoplasmique (RE) et affecte la fonction de protéines sécrétées. Notre groupe a récemment identifié une nouvelle protéine gamma-carboxylée, ERGP (Endoplasmic Reticulum Gla Protein) qui prévient le dysfonctionnement des cellules bêta en présence d’un stress métabolique (Cell Reports 2023). Nos résultats suggèrent qu’ERGP, lorsque gamma-carboxylée, module l’entrée de calcium par les canaux CRAC composés de STIM1 et ORAI (voir schéma à gauche).

Notre objectif actuel est de déchiffrer les mécanismes moléculaires et les voies de signalisation cellulaires par lesquels ERGP et la gamma-carboxylation régulent les flux calciques et la sécrétion d’insuline dans les cellules bêta de souris et humaines. Outre ERGP, nous avons découvert plusieurs nouvelles protéines gamma-carboxylées dans les cellules bêta, et qui semblent impliquées dans le repliement des protéines et le contrôle de la qualité dans le RE. Par conséquent, nous cherchons également à comprendre comment la gamma-carboxylation contrôle la machinerie de repliement des protéines dans le RE. Notre objectif à long terme est d’identifier de nouvelles cibles potentielles pour le traitement ou la prévention du diabète de type 2.

Le projet tirera parti d’un large éventail d’approches pour découvrir les fonctions cellulaires, moléculaires et physiologiques d’ERGP et de la gamma-carboxylation dans les cellules bêta.  Ce projet nécessitera des analyses en microscopie (imagerie Ca²⁺, FRET, etc.), de protéomique (BioID, modifications post-traductionnelles, etc.) et l’utilisation de modèles de souris génétiquement modifiées par CRISPR-Cas9. Les résultats pourront ensuite être validés chez l’humain en utilisant des îlots pancréatiques de donneurs avec ou sans diabètes. Ce projet est financé par les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC). Bourse annuelle minimale de 28 000 $ (doctorat) et 45 000 $ (post-doctorat) avec possibilité de bonus !

Publications récentes :

GAS6 and AXL promote insulin resistance by rewiring insulin signaling and increasing insulin receptor trafficking to endosomes. Diabetes. 2024. Online Ahead of Print.

Novel Function of Vitamin K-Dependent Carboxylation in Beta-Cells and Diabetes. Trends Endocrinol Metab. 2024. (PMID: 38429160)

Vitamin K-dependent carboxylation regulates Ca2+ flux and adaptation to metabolic stress in beta-cells. Cell Reports. 2023. (PMID: 37171959)

Courriel : mathieu.ferron@ircm.qc.ca

(Août 2024)

L’unité de recherche en physiologie moléculaire, dirigée par le Dr. Mathieu Ferron, à l’Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM) recherche des étudiant.e.s au doctorat en biochimie et des stagiaires postdoctoraux intéressé.es par la biologie cellulaire, la biochimie et le métabolisme énergétique.

Ce projet s’intéresse à l’enzyme VKORC1L1 impliqué dans le recyclage de la vitamine K et à son rôle dans le développement de la stéatose hépatique non-alcoolique et du HCC. Nous avons découvert que VKORC1L1 non seulement protégeait de la stéatose hépatique, mais prévenait la génération espèces réactives de l’oxygène, la dysfonction mitochondriale, les dommages à l’ADN, l’aneuploïdie et le carcinome hépatocellulaire (HCC). Notre objectif est maintenant de comprendre par quelle voies métaboliques et cellulaires VKORC1L1 protège les hépatocytes de la stéatose et de la carcinogénèse.

Le projet tirera parti d’un large éventail d’approches pour découvrir les fonctions cellulaires et moléculaires de VKORC1L1.  Ce projet nécessitera des analyses de métabolomique, de lipidomique, de protéomique (BioID) et l’utilisation de modèles de souris génétiquement modifiées. Les résultats pourront ensuite être validés dans des organoïdes de foie humain en collaboration avec le Early Drug Discovery Unit (EDDU) de McGill et dans des cellules cancéreuses humaines (HCC). Ce projet est financé par les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC). Bourse annuelle minimale de 28 000 $ (doctorat) et 45 000 $ (post-doctorat) avec possibilité de bonus !

Publications récentes sur ce sujet :

GAS6 and AXL promote insulin resistance by rewiring insulin signaling and increasing insulin receptor trafficking to endosomes. Diabetes. 2024. Online Ahead of Print.

Vitamin K-dependent carboxylation regulates Ca2+ flux and adaptation to metabolic stress in beta-cells. Cell Reports. 2023. (PMID: 37171959)

VKOR paralog VKORC1L1 supports vitamin K-dependent protein carboxylation in vivo. JCI Insight. 2018. (PMID: 29321368)

Courriel : mathieu.ferron@ircm.qc.ca

(Août 2024)

Two research positions are available in the Laboratory of Signaling and Cell Growth headed by Dr Sylvain Meloche and located at the Institut de Recherche en Immunologie et Cancérologie (IRIC) affiliated to Université de Montréal (http://www.iric.ca/).

The laboratory uses an interdisciplinary approach that combines molecular and cellular biology, functional genomics/proteomics, mouse genetics and chemical biology to understand how signal transduction pathways control cell fate of normal and cancer cells. Defining the importance and interconnection of these signaling events will further our understanding of the malignant transformation process and aid in the identification of new cancer targets for preclinical validation. Current research of the laboratory is focused on understanding the regulation and pathophysiological functions of members of the MAP kinases and SRC-family kinases, which are essential regulators of cell proliferation and differentiation. Several members of these protein kinase families have been shown to play causative roles in developmental disorders and various cancers. The laboratory has developed several models of genetically-engineered mice and chemical tools to study the role of these enzymes in cancer. Specifically, the team is actively involved in large-scale drug discovery projects aimed at developing novel small molecule inhibitors of ERK3/4 and YES kinases.

Specific projects:

• Investigating the role of SRC-family kinases (SFKs) in immunogenic cell death and anti-tumor immunity

In addition to sustaining chronic proliferation, oncogenic signaling pathways also contribute to tumorigenesis by facilitating immune surveillance escape. Our preliminary findings suggest that SFKs regulate anti-tumor immune responses in specific cancers. Questions to address include: defining the role of different SFK members on immune cell populations using specific genetic and pharmacological tools; defining the role of SFKs in immunogenic cell death; investigating the role of SFKs in anti-tumor immunity in various mouse models of cancer; testing the pharmacological potential of SFK inhibition in combination with immunotherapy.

• Investigating the role of ERK3/ERK4 signaling in cellular invasion and metastatic progression using cellular and mouse models of cancer

Accumulating evidence points to an important role of the atypical MAP kinases ERK3 and ERK4 in cancer development and progression. Genetic depletion of ERK3 reduces metastatic dissemination of lung and breast cancer cells. Among the questions we want to address are: defining the role of ERK3/ERK4 signaling in epithelial-mesenchymal transition; defining the role of ERK3/ERK4 in metastatic progression and cellular dormancy; elucidating the signaling network of ERK3/ERK4 driving cancer progression using a multi-omic approach. Validating the translational potential of ERK3/ERK4 using a novel generation of chemical inhibitors.

Candidates should have a degree in biochemistry, molecular biology, immunology, or related fields. Experience in molecular and cellular biology, immunology, or omics research is desirable. Interested individuals should send their full CV, a letter of motivation and the names of two references to:

Dr Sylvain Meloche
Professor of Pharmacology and Physiology
Institute for Research in Immunology and Cancer
E-mail: sylvain.meloche@umontreal.ca
Phone: (514) 343-6966

(Mai 2024)

La réplication de l’ADN est un processus fondamental qui permet la duplication du matériel génétique et son transfert subséquent aux cellules filles. Les dommages à l’ADN causés par des agents environnementaux ou des médicaments anticancer peuvent empêcher la réplication de l’ADN et provoquer l’instabilité génomique. Notre laboratoire étudie les mécanismes qui permettent aux cellules de répondre aux dommages à l’ADN survenant pendant la réplication. Nos projets de recherche visent à mieux comprendre l’impact de ces mécanismes dans le contexte du cancer de l’ovaire et du mélanome malin; nous utilisons des approches de biologie moléculaire, biochimie, et génétique, ainsi que des modèles expérimentaux allant de la levure aux cellules mammifères en culture.

Nous recherchons des candidat(e)s pour des études de MSc, PhD, ou postdoctorales intéressé(e)s par la recherche sur le cancer et les mécanismes fondamentaux influençant la stabilité génomique chez les eucaryotes. Les candidat(e)s doivent répondre aux critères d’admissibilité du programme de biologie moléculaire de l’Université de Montréal : des études antérieures dans le domaine de la biochimie et de la biologie moléculaire sont essentielles. Les candidat(e)s ayant une expérience en laboratoire et de solides compétences académiques seront privilégié(e)s. Les projets se dérouleront au Centre de Recherche de l’Hôpital Maisonneuve-Rosemont, une installation de formation de premier plan affiliée à l’Université de Montréal, dans le laboratoire du Dr Hugo Wurtele (https://crhmr.ciusss-estmtl.gouv.qc.ca/en/researcher/hugo-wurtele ). Les candidat(e)s intéressé(e)s doivent envoyer un CV, une lettre de motivation et leurs relevés de notes universitaires.

Publications appropriées:

Lemay J-F, St-Hilaire E, Gezzar-Dandashi S, McQuaid M, Ronato DA, Gao Y, Bélanger F, Sawchyn C, Kimenyi Ishimwe AB, Mallette FA, Masson J-Y, Drobetsky EA, Wurtele H (2022) A genome-wide screen identifies SCAI as a modulator of the UV-induced replicative stress response in human cells. PLoS Biol. 2022 Oct 10;20(10)

Bélanger F, Roussel C, Sawchyn C, Gezzar-Dandashi S, Mallette FA, Wurtele H*, Drobetsky EA* (2023) Control of UV damage repair during S phase via Dyrk1A-dependent regulation of cyclin D1/p21waf1cip1 stability. Journal of Biological Chemistry 8: 104900, doi: 10.1016/j.jbc.2023.104900

Bélanger F, Fortier E, Dubé M, Lemay JF, Buisson R, Masson JY, Elsherbiny A, Costantino S, Carmona E, Mes-Masson AM, Wurtele H, Drobetsky E. (2018) Replication Protein A Availability during DNA Replication Stress Is a Major Determinant of Cisplatin Resistance in Ovarian Cancer Cells. Cancer Res. 78:5561-5573

(Août 2024)

La gamma-carboxylation est une modification post-traductionnelle qui cible les résidus d’acides glutamiques, se produit dans le réticulum endoplasmique (RE) et affecte la fonction de protéines sécrétées. Notre groupe a récemment identifié une nouvelle protéine gamma-carboxylée, ERGP (Endoplasmic Reticulum Gla Protein) qui prévient le dysfonctionnement des cellules bêta en présence d’un stress métabolique (Cell Reports 2023). Nos résultats suggèrent qu’ERGP, lorsque gamma-carboxylée, module l’entrée de calcium par les canaux CRAC composés de STIM1 et ORAI (voir schéma à gauche).

Notre objectif actuel est de déchiffrer les mécanismes moléculaires et les voies de signalisation cellulaires par lesquels ERGP et la gamma-carboxylation régulent les flux calciques et la sécrétion d’insuline dans les cellules bêta de souris et humaines. Outre ERGP, nous avons découvert plusieurs nouvelles protéines gamma-carboxylées dans les cellules bêta, et qui semblent impliquées dans le repliement des protéines et le contrôle de la qualité dans le RE. Par conséquent, nous cherchons également à comprendre comment la gamma-carboxylation contrôle la machinerie de repliement des protéines dans le RE. Notre objectif à long terme est d’identifier de nouvelles cibles potentielles pour le traitement ou la prévention du diabète de type 2.

Le projet tirera parti d’un large éventail d’approches pour découvrir les fonctions cellulaires, moléculaires et physiologiques d’ERGP et de la gamma-carboxylation dans les cellules bêta.  Ce projet nécessitera des analyses en microscopie (imagerie Ca²⁺, FRET, etc.), de protéomique (BioID, modifications post-traductionnelles, etc.) et l’utilisation de modèles de souris génétiquement modifiées par CRISPR-Cas9. Les résultats pourront ensuite être validés chez l’humain en utilisant des îlots pancréatiques de donneurs avec ou sans diabètes. Ce projet est financé par les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC). Bourse annuelle minimale de 28 000 $ (doctorat) et 45 000 $ (post-doctorat) avec possibilité de bonus !

Publications récentes :

GAS6 and AXL promote insulin resistance by rewiring insulin signaling and increasing insulin receptor trafficking to endosomes. Diabetes. 2024. Online Ahead of Print.

Novel Function of Vitamin K-Dependent Carboxylation in Beta-Cells and Diabetes. Trends Endocrinol Metab. 2024. (PMID: 38429160)

Vitamin K-dependent carboxylation regulates Ca2+ flux and adaptation to metabolic stress in beta-cells. Cell Reports. 2023. (PMID: 37171959)

Courriel : mathieu.ferron@ircm.qc.ca

(Août 2024)

L’unité de recherche en physiologie moléculaire, dirigée par le Dr. Mathieu Ferron, à l’Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM) recherche des étudiant.e.s au doctorat en biochimie et des stagiaires postdoctoraux intéressé.es par la biologie cellulaire, la biochimie et le métabolisme énergétique.

Ce projet s’intéresse à l’enzyme VKORC1L1 impliqué dans le recyclage de la vitamine K et à son rôle dans le développement de la stéatose hépatique non-alcoolique et du HCC. Nous avons découvert que VKORC1L1 non seulement protégeait de la stéatose hépatique, mais prévenait la génération espèces réactives de l’oxygène, la dysfonction mitochondriale, les dommages à l’ADN, l’aneuploïdie et le carcinome hépatocellulaire (HCC). Notre objectif est maintenant de comprendre par quelle voies métaboliques et cellulaires VKORC1L1 protège les hépatocytes de la stéatose et de la carcinogénèse.

Le projet tirera parti d’un large éventail d’approches pour découvrir les fonctions cellulaires et moléculaires de VKORC1L1.  Ce projet nécessitera des analyses de métabolomique, de lipidomique, de protéomique (BioID) et l’utilisation de modèles de souris génétiquement modifiées. Les résultats pourront ensuite être validés dans des organoïdes de foie humain en collaboration avec le Early Drug Discovery Unit (EDDU) de McGill et dans des cellules cancéreuses humaines (HCC). Ce projet est financé par les Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC). Bourse annuelle minimale de 28 000 $ (doctorat) et 45 000 $ (post-doctorat) avec possibilité de bonus !

Publications récentes sur ce sujet :

GAS6 and AXL promote insulin resistance by rewiring insulin signaling and increasing insulin receptor trafficking to endosomes. Diabetes. 2024. Online Ahead of Print.

Vitamin K-dependent carboxylation regulates Ca2+ flux and adaptation to metabolic stress in beta-cells. Cell Reports. 2023. (PMID: 37171959)

VKOR paralog VKORC1L1 supports vitamin K-dependent protein carboxylation in vivo. JCI Insight. 2018. (PMID: 29321368)

Courriel : mathieu.ferron@ircm.qc.ca

(Août 2024)

Two research positions are available in the Laboratory of Signaling and Cell Growth headed by Dr Sylvain Meloche and located at the Institut de Recherche en Immunologie et Cancérologie (IRIC) affiliated to Université de Montréal (http://www.iric.ca/).

The laboratory uses an interdisciplinary approach that combines molecular and cellular biology, functional genomics/proteomics, mouse genetics and chemical biology to understand how signal transduction pathways control cell fate of normal and cancer cells. Defining the importance and interconnection of these signaling events will further our understanding of the malignant transformation process and aid in the identification of new cancer targets for preclinical validation. Current research of the laboratory is focused on understanding the regulation and pathophysiological functions of members of the MAP kinases and SRC-family kinases, which are essential regulators of cell proliferation and differentiation. Several members of these protein kinase families have been shown to play causative roles in developmental disorders and various cancers. The laboratory has developed several models of genetically-engineered mice and chemical tools to study the role of these enzymes in cancer. Specifically, the team is actively involved in large-scale drug discovery projects aimed at developing novel small molecule inhibitors of ERK3/4 and YES kinases.

Specific projects:

• Investigating the role of SRC-family kinases (SFKs) in immunogenic cell death and anti-tumor immunity

In addition to sustaining chronic proliferation, oncogenic signaling pathways also contribute to tumorigenesis by facilitating immune surveillance escape. Our preliminary findings suggest that SFKs regulate anti-tumor immune responses in specific cancers. Questions to address include: defining the role of different SFK members on immune cell populations using specific genetic and pharmacological tools; defining the role of SFKs in immunogenic cell death; investigating the role of SFKs in anti-tumor immunity in various mouse models of cancer; testing the pharmacological potential of SFK inhibition in combination with immunotherapy.

• Investigating the role of ERK3/ERK4 signaling in cellular invasion and metastatic progression using cellular and mouse models of cancer

Accumulating evidence points to an important role of the atypical MAP kinases ERK3 and ERK4 in cancer development and progression. Genetic depletion of ERK3 reduces metastatic dissemination of lung and breast cancer cells. Among the questions we want to address are: defining the role of ERK3/ERK4 signaling in epithelial-mesenchymal transition; defining the role of ERK3/ERK4 in metastatic progression and cellular dormancy; elucidating the signaling network of ERK3/ERK4 driving cancer progression using a multi-omic approach. Validating the translational potential of ERK3/ERK4 using a novel generation of chemical inhibitors.

Candidates should have a degree in biochemistry, molecular biology, immunology, or related fields. Experience in molecular and cellular biology, immunology, or omics research is desirable. Interested individuals should send their full CV, a letter of motivation and the names of two references to:

Dr Sylvain Meloche
Professor of Pharmacology and Physiology
Institute for Research in Immunology and Cancer
E-mail: sylvain.meloche@umontreal.ca
Phone: (514) 343-6966

(Mai 2024)