Coordonnées
Chercheur, Axe Pathologies fœtomaternelles et néonatales
Centre de Recherche du CHU Sainte-Justine, Montréal
Axes de recherche
- Développement et différenciation tissulaire
- Cellules souches
- Génomique
- Génétique humaine et maladies génétiques
Description de la recherche
L’infertilité et la baisse des taux de natalité sont des problèmes majeurs dans les sociétés développées, environ 15 % des couples ayant recours à la procréation assistée. Chez les femmes, le principal problème est la diminution drastique de la qualité et du nombre d’ovocytes avec l’âge. Le développement des cellules germinales humaines ne peut pas être étudié de manière mécanistique in vivo, car les perturbations expérimentales ne sont pas faisables, ce qui fait des systèmes in vitro utilisant des cellules souches pluripotentes une alternative prometteuse. Alors que des progrès étonnants ont été réalisés dans le système modèle de la souris, y compris la naissance de souris vivantes à partir d’ovocytes dérivés in vitro, le système in vitro humain est en retard, n’atteignant que les premiers stades des cellules germinales. Un obstacle majeur a été de reproduire fidèlement le reprogrammation épigénétique pour effacer et établir les marques épigénétiques, ce qui est essentiel pour la maturation des cellules germinales et la santé de la progéniture in vivo.
Un des événements épigénétiques clés durant le développement féminin est l’inactivation de l’un des deux chromosomes X, nécessaire pour créer une parité de dosage des gènes liés au chromosome X avec les mâles, qui possèdent un X et un chromosome Y. L’inactivation du chromosome X est inversée par la réactivation du chromosome X lors de la reprogrammation des cellules souches pluripotentes et dans la lignée des cellules germinales, avant que les cellules n’entrent en méiose et en ovogenèse. Dans notre laboratoire, nous étudions les mécanismes de ce remodelage épigénétique du chromosome X et cherchons à comprendre pourquoi, au cours du développement féminin, un chromosome entier doit être éteint puis réactivé. Notre recherche a des implications pour la compréhension des mécanismes de reprogrammation épigénétique, des maladies liées au chromosome X, qui affectent de manière disproportionnée les femmes, et pour la création de meilleurs modèles de cellules souches pour le développement des ovocytes.
Les axes de recherche passés et présents dans notre laboratoire comprennent :
- Étudier les liens entre la réactivation du chromosome X et la pluripotence lors de la reprogrammation des iPSC.
- Décrypter le rôle de l’inactivation et de la réactivation du chromosome X pour le développement in vitro des ovocytes en utilisant des modèles d’organoïdes dérivés de cellules souches avancés.
- Utiliser des méthodologies telles que le criblage CRISPR, l’ingénierie des cellules souches, la transcriptomique et l’épigénomique à cellule unique pour révéler les mécanismes moléculaires du remodelage épigénétique et structurel du chromosome X.
- Développer des modèles de cellules souches spécifiques aux patients pour le développement in vitro des cellules germinales.
- Étudier les bases moléculaires du vieillissement des ovocytes humains.
Research axis
- Development and differentiation
- Stem cells
- Genomics
- Human genetics and genetic disease
Research description
Infertility and a drop in birth rates are major problems in developed societies, with around 15% of couples resorting to assisted reproduction. In women, the main issue is the dramatic decline in oocyte quality and number with age. Human germ cell development cannot be studied mechanistically in vivo as experimental perturbations are unfeasible, making in vitro systems using pluripotent stem cells a promising alternative. While astonishing progress has been achieved in the mouse model system, including live birth from in vitro derived oocytes, the human in vitro system lags behind reaching early germ cell stages. A major bottleneck has been faithful recapitulating epigenetic reprogramming to erase and establish epigenetic marks, which is critical for germ cell maturation, and offspring health in vivo.
One of the key epigenetic events during female development is the inactivation of one of the two X chromosomes, which is necessary to create X-linked gene dosage parity with males, which have one X and a Y chromosome. X-chromosome inactivation is reversed by X-chromosome reactivation during reprogramming of pluripotent stem cells and in the germ cell lineage, before cells enter meiosis and oogenesis. In our lab, we study the mechanisms of this epigenetic remodeling of the X-chromosome and want to find out, why during female development an entire chromosome needs to be switched OFF and ON again. Our research has implications for understanding epigenetic reprogramming mechanisms, X-linked diseases, which affect disproportionally women, and for generating better stem cell models of oocyte development.
Past and present research lines in our lab include:
- Investigating the links between X-chromosome reactivation and pluripotency during iPSC-reprogramming.
- Deciphering the role of X-chromosome inactivation and reactivation for in vitro oocyte development using advanced stem cell-derived organoid models.
- Using methodology such as CRISPR-screening, stem cell engineering, single-cell transcriptomics and epigenomics to reveal molecular mechanisms of epigenetic and structural remodeling of the X-chromosome.
- Developing patient-specific stem cell models of in vitro germ cell development.
- Studying the molecular basis of human oocyte aging.
Publications
- Barrero, M., Lopez-Rubio, A.V., Lazarenkov, A., Blanco, E., Bauer, M., Palma, L.G., Bigas, A., Di Croce, L., Sardina, J.L. and Payer, B. (2024). The Interferon γ Pathway Enhances Pluripotency and X-Chromosome Reactivation in iPSC reprogramming. Science Advances, 10, eadj8862.DOI: 10.1126/sciadv.adj8862
- Mattimoe, T. and Payer, B. (2023). The compleX balancing act of controlling X-chromosome dosage and how it impacts mammalian germline development. Biochemical Journal, 480, 521-537.DOI: 10.1042/BCJ20220450
- Severino, J., Bauer, M., Mattimoe, T., Arecco, N., Cozzuto, L., Lorden, P., Hamada, N., Nosaka, Y., Nagaoka, S.I., Audergo, P., Tarruell, A., Heyn, H., Hayashi, K., Saitou, M. and Payer, B. (2022). Controlled X‐chromosome dynamics defines meiotic potential of female mouse in vitro germ cells. The EMBO Journal, 41, e109457.DOI: 10.15252/embj.2021109457
- Llonch, S., Barragan, M., Nieto, P., Mallol A., Elosua-Bayes, M., Lorden, P., Ruiz, S., Zambelli, F., Heyn, H., and Vassena, R. and Payer, B. (2021). Single human oocyte transcriptome analysis reveals distinct maturation stage‐dependent pathways impacted by age. Aging Cell, e13360.DOI: 10.1111/acel.13360
- Bauer, M., Vidal, E., Zorita, E., Üresin, N., Pinter, S.F., Filion, G.J. and Payer, B. (2021). Chromosome Compartments on the Inactive X Guide TAD Formation Independently of Transcription during X-Reactivation. Nature Communications, 12, 3499.DOI: 10.1038/s41467-021-23610-1