Coordonnées
IRCM
514 987-5646
eric.lecuyer@ircm.qc.ca
Sites web du labo :
https://www.ircm.qc.ca/en/researchers/eric-lecuyer (site IRCM)
https://www.lecuyerlab.org/ (personnel)
Axes de recherche
- Génomique
- Bioinformatique
- Systèmes modèles en biologie moléculaire
- Biologie des systèmes
Description de la recherche
Le transport intracellulaire des ARNm, combiné à leur traduction localisée, représente un mécanisme exquis pour contrôler l’organisation cellulaire et le ciblage des modules protéiques. Ce mécanisme joue un rôle important dans une variété de processus biologiques, incluant la spécification des axes embryonnaires durant le développement, la migration et l’adhésion cellulaire, et la division cellulaire asymétrique. Des études génomiques récentes suggèrent que la localisation des ARNm représente un processus hautement prévalent, qui pourrait jouer un rôle majeur dans l’organisation cellulaire. Notre laboratoire s’intéresse à élucider i) les mécanismes moléculaires et les fonctions biologiques du transport intracellulaire des ARNm, ii) comment les altérations de ces processus peuvent engendrer des maladies, et iii) comment ces connaissances peuvent servir à l’élaboration de nouvelles approches thérapeutiques à base d’ARN. Pour comprendre ces processus, nous employons une variété d’approches expérimentales, incluant la biologie moléculaire et cellulaire, la biochimie, la bioinformatique, la génétique de la drosophile et des stratégies de génomique fonctionnelle impliquant la microscopie à haut-débit et la transcriptomique intracellulaire.
Research axis
- Genomics
- Bioinformatics
- Model Systems in Molecular Biology
- Systems Biology
Research description
The intracellular transport of mRNAs, combined with their localized translation, represents an exquisite mechanism to control the distribution of protein modules in the cell. This mechanism plays an important role in a variety of biological processes, including the specification of embryonic axes during development, cell migration and adhesion, and asymmetric cell division. Recent genomic studies suggest that mRNA localization represents a highly prevalent process, which could play a major role in cellular organization. Our laboratory is interested in elucidating i) the molecular mechanisms and biological functions of intracellular RNA transport, ii) how alterations of these processes can lead to disease, and iii) how this knowledge can be used to develop new RNA-based therapeutic approaches. To understand these processes, we employ a variety of experimental approaches, including molecular and cellular biology, biochemistry, bioinformatics, Drosophila genetics and functional genomics strategies involving high-throughput microscopy and intracellular transcriptomics.
Publications
- Benoit Bouvrette, L.P., Wang, X., Boulais, J., Kong, J., Syed, E.U., Blue, S., Zhan, L., Olson, S., Stanton, R., Wei, X., Yee, B., Van Nostrand, E.L., Fu, X.-D., Burge, C.B., Graveley, B.R., Yeo, G.W., Lécuyer, E. (2022) RBP Image Database: A resource for the systematic characterization of the subcellular distribution properties of human RNA binding proteins. Nucleic Acids Research (In press).
- Benoit Bouvrette, L.P., Bovaird, S., Blanchette, M., and Lécuyer, E. (2020). oRNAment: A database of putative RNA binding protein target sites in transcriptomes of model species. Nucleic Acids Research, 48: D166-D173.
- Bergalet, J., Patel, D., Legendre, F., Lapointe, C., Benoit Bouvrette, L.P., Chin, A., Blanchette, M., Kwon, E, and Lécuyer, E. (2020). Inter-dependent centrosomal co-localization of cen and ik2 cis-natural antisense mRNAs in Drosophila. Cell Reports, 30: 3339-3352.
- Van Nostrand, E.L.*, Freese, P.*, Pratt, G.A.*, Wang, X.*, Wei, X.*, Xiao, R.*, Blue, S.M., Dominguez, D., Cody, N.A.L., Olson, S., Sundararaman, B., Zhan, L., Bazile, C., Bouvrette, L.P.B., Chen, J., Duff, M.O., Garci, K.E., Gelboin-Burkhart, C., Hochman, A., Lambert, N.J., Li, H., Ngueyn, T.B., Palden, T., Rabano, I., Sathe, S., Stanton, R., Bergalet, J., Zhou, B., Su, A., Wang, R., Yee, B.A., Louie, A. L., Aigner, S., Fu, X.-D.¶, Lécuyer, E. ¶, Burge, C.B¶., Graveley, B.R. ¶, Yeo, G.W. ¶ 2020. A large-scale binding and functional map of human RNA binding proteins. Nature, 583: 711-719. *-co-first authors, ¶= co-corresponding authors.
- Markmiller, S., Soltanieh, S., Server, K.L., Mak, R., Jin, W., Fang, M.Y., Lui, E.-C., Krach, F., Yang, D., Sen, A., Gao, F.-B., Kandel, M.W., Bennett, E.J., Lécuyer, E. and Yeo, G.W. 2018. Context-dependent and disease-specific diversity in stress granules formed form pre-existing protein interactions. Cell, 172: 590-604.