Coordonnées
Centre de recherche du CHU Sainte-Justine
Université de Montréal
Département de pathologie et biologie cellulaire
Bureau 6.17.027
3175 Chemin de la Côte-Sainte-Catherine
Montréal, Québec H3T 1C5
T 514-345-4931 poste 5199
Axes de recherche
- Protéomique
- Bioinformatique
- Biologie des systèmes
- Cancérologie
Description de la recherche
L’objectif principal du laboratoire est de développer et d’appliquer des approches de spectrométrie de masse pour améliorer les stratégies de vaccination et d’immunothérapie contre le cancer, les maladies autoimmunes et les maladies infectieuses. Notre laboratoire utilise des approches de protéomique, d’immunopeptidomique, de bioinformatique et de spectrométrie de masse computationnelle. Notre programme de recherche multidisciplinaire est hautement collaboratif et nous visons à avoir un impact significatif sur les soins aux patients dans le monde entier.
Research axis
- Proteomics
- Bioinformatics
- Systems Biology
- Cancer
Research description
The overarching goal of the laboratory is to develop and apply mass spectrometry approaches to improve vaccine and immunotherapy strategies against cancer, autoimmunity and infectious diseases. Our laboratory use proteomics, immunopeptidomics, bioinformatics and computational mass spectrometry approaches. Our multidisciplinary research program is highly collaborative by nature and we aim to have a significant impact on patient care worldwide.
Publications
- Vizcaíno JA, Kubiniok P, Kovalchik KA, Ma Q, Duquette JD, Mongrain I, Deutsch EW, Peters B, Sette A, Sirois I, Caron E. The Human Immunopeptidome Project: a Roadmap to Predict and Treat Immune Diseases. Mol. Cell. Proteomics. 2020, 19:31-49.
- Schuster H, Shao W, Weiss T, Pedrioli P, Roth P, Weller M, Campbell DS, Deutsch EW, Moritz RL, Rammensee HG, Aebersold R, Caron E. A tissue-based draft map of the murine MHC class I immunopeptidome. Sci. Data. 2018, 5:180157.
- Shao W, Pedrioli P, Wolski W, Scurtescu C, Schmid E, Vizcaino JA, Courcelles M, Schuster H, Kowalewski D, Marino F, Arlehamn CSL, Vaughan K, Peters B, Sette A, Ottenhoff THM, Meijgaarden KE, Nieuwenhuizen N, Kaufmann SHE, Schlapbach R, Castle JC, Nesvizhskii AI, Nielsen M, Deutsch EW, Campbell DS, Moritz RL, Zubarev RA, Ytterberg AJ, Purcell AW, Marcilla M, Paradela A, Wang Q, Costello CE, Ternette N, van Veelen PA, van Els CACM, Heck AJR, de Souza GA, Sollid LM, Admon A, Stevanovic S, Rammensee HG, Thibault P, Perreault C, Bassani-Sternberg M, Aebersold R, and Caron E*. The SysteMHC Atlas project. Nucleic Acids Res. 2018, 46(D1):D1237-D1247.
- Caron E, Aebersold R, Banaei-Esfahani A, Chong C, Bassani-Sternberg M. A Case for a Human Immuno-Peptidome Project Consortium. Immunity. 2017, 47:203-208.
- Caron E, Roncagalli R, Takeshi H, Wolski WE, Meena C, Menoita MG, Durand S, Garcia-Blesa A, Fierro-Monti I, Sajic T, Heusel M, Weiss T, Malissen M, Schlapbach R, Collins B, Ghosh S, Kitano H, Aebersold R, Malissen B, Gstaiger M. Precise temporal profiling of protein signaling complexes in primary cells using SWATH mass spectrometry. Cell Rep. 2017, 18:3219-3226.