Wilhelm, Brian, Ph.D.

Assistant professeur
Département de médecine

Coordonnées

1306-11, IRIC – UdeM
Pavillon Marcelle-Coutu, 2950 chemin de Polytechnique
T 514-343-6111 #0923
F 514-343-7780
brian.wilhelm@umontreal.ca

2900, boulevard Édouard-Montpetit
Pavillon Marcelle-Coutu, Quai 20
Montreal (Québec)  H3T 1J4
CANADA

Axes de recherche

  • Génomique
  • Cancer
  • Bioinformatique
  • Systèmes modèles en biologie moléculaire

Description de la recherche

La régulation transcriptionnelle est un processus complexe qui exige le recrutement de l’ARN polymérase vers les sites dirigés de transcription, la modification de la structure locale de la chromatine et l’épissage des nouveaux transcrits. Une interruption de la coordination de ce processus, comme la transcription erronée qui active de façon inappropriée des gènes qui modifient le comportement normal des cellules, peut favoriser l’apparition d’un cancer. Dans le but de comprendre clairement la nature de cette anomalie, il est souvent nécessaire d’avoir un aperçu global du système.

Notre équipe de recherche s’intéresse actuellement à l’utilisation des technologies d’avant-garde, à haut débit, comme les biopuces à ADN et le séquençage d’ADN de nouvelle génération afin d’élucider les connexions sous-jacentes à l’activité transcriptionnelle et au comportement des cellules. Pour comprendre ce phénomène dans le contexte de la biologie du cancer, nous utilisons actuellement ces approches pour caractériser les échantillons de patients atteints de la leucémie myéloïde aiguë (LMA) dans le but d’identifier les mutations qui favorisent l’apparition de la maladie. De plus, nous utilisons la levure à fission (Schizosaccharomyces pombe) comme système modèle pour étudier le recrutement de l’ARN polymérase II et son comportement pendant la transcription. Le fait de mieux comprendre la machinerie moléculaire qui est à la base de ces processus nous permettra ultimement de mettre au point de nouveaux médicaments pour traiter le cancer.

Research Axis

  • Genomics
  • Cancer
  • Bioinformatics
  • Model systems in molecular biology

Research description

Transcriptional regulation is a complex process requiring the recruitment of RNA Polymerase to directed sites of transcription, modification of the local chromatin structure, and coordinated splicing and export of the novel transcript. A breakdown in the coordination of this process, such as misdirected transcription which inappropriately activates genes that alter the cells normal behaviour, can result in the development of cancer. In order to clearly understand the exact nature of the defect, it is often necessary to acquire a global view of the system.

Our research team is currently interested in using cutting-edge, high-throughput technologies such as microarrays and next-generation sequencing to elucidate the connections underlying transcriptional activity and cellular behaviour. To understand this in the context of cancer biology, we are currently using these approaches to characterize primary Acute Myeloid Leukemia (AML) patient samples in order to identify mutations giving rise to the disease. Additionally, we use fission yeast (Schizosaccharomyces pombe) as a model system to study the recruitment of RNA Polymerase II and its behaviour during transcription. Gaining a better understanding of the molecular machinery behind these processes will ultimately better enable us to develop novel drugs to treat cancer.

Publications

  • Wilhelm BT, Briau M, Austin P, Faubert A, Boucher G, Chagnon P, Hope K, Girard S, Mayotte N, Landry JR, Hébert J, Sauvageau G. RNA-seq analysis of 2 closely related leukemia clones that differ in their self-renewal capacity. Blood. 2011 Jan 13;117(2):e27-38. Epub 2010 Oct 27. PubMed PMID: 20980679.
  • Wilhelm BT, Marguerat S, Aligianni S, Codlin S, Watt S, Bähler J. Differential patterns of intronic and exonic DNA regions with respect to RNA polymerase II occupancy, nucleosome density and H3K36me3 marking in fission yeast. Genome Biol. 2011 Aug 22;12(8):R82. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21859475.
  • Wilhelm BT, Marguerat S, Watt S, Schubert F, Wood V, Goodhead I, Penkett CJ, Rogers J, Bähler J. Dynamic repertoire of a eukaryotic transcriptome surveyed at single-nucleotide resolution. Nature. 2008 Jun 26;453(7199):1239-43. Epub 2008 May 18. PubMed PMID: 18488015.
  • Wilhelm BT, Mager DL. Rapid expansion of the Ly49 gene cluster in rat. Genomics. 2004 Jul;84(1):218-21. PubMed PMID: 15203220.
  • Wilhelm BT, Landry JR, Takei F, Mager DL. Transcriptional control of murine CD94 gene: differential usage of dual promoters by lymphoid cell types. J Immunol. 2003 Oct 15;171(8):4219-26. PubMed PMID: 14530345.

This post is also available in: Anglais

© Programmes de biologie moléculaire - Faculté de médecine de l'Université de Montréal